《科学认识史论/东大哲学典藏·萧焜焘文丛》旨在历史地论证从自然哲学到精神哲学的“科学体系”的逻辑合理性与历史趋归性。它历史地又合乎逻辑地论述了哲学与科学分合的历史观，相应于古希腊时期，是西欧哲学科学知识的启蒙与形成阶段；从中世纪到文艺复兴时期，是澄清宗教迷雾、实证科学兴起的阶段；迄于近现代，辩证法在唯物的基础上重新崛起，科学技术整体化趋势又客观地证实了辩证法的真理性，从而达到哲学与科学的融合、工程技术的理论概念形态便是这种融合的产物，它成了现代哲学唯物论的科学技术基础。《科学认识史论/东大哲学典藏·萧焜焘文丛》是萧焜焘先生多年构思、长期思考取得的成果。
这本著作旨在论述哲学与科学的历史发展同源而分流，而又复归于综合的辩证过程。而且，它客观地昭示哲学的确立必须以科学为前提；科学的前进必然以哲学为归宿。这个哲学与科学交叉发展、滚动推移的当代辩证综合的结果是：以工程技术为前提的马克思哲学唯物主义的现代形态的诞生。它就是这个系列著作的前两部：《自然哲学》与《精神哲学》。这是一个严格遵循马克思哲学原则，依托当代自然科学、技术科学、社会科学、人文科学的高度综合化、整体化，上升到哲学层次的“工程技术”而结晶的“现代哲学唯物论”体系。它排除了教条主义与西方科学主义的干扰，力图重振马克思学说的雄风。
作为概念系统的哲学与科学的同源性
公元前6世纪前后，以古希腊为代表的西欧开始克服神话的直观想象，以理智的态度审视我们生存于其中的这个客观世界，出现了一批自然哲学家。理智地，也就是知性地关于宇宙自然的阐述，使用的思维工具是“概念”。概念是理智运行的凭借，在理智思维过程中，感性直观素材的外在性、表面性被扬弃，内在的本质被知性的解剖作用分析出来，进一步被理性的综合作用所把握。这个综合分为两个层次：浅层次形成“知性概念”（conception）；深层次形成“辩证概念（Begriff）”。
哲学与科学都是概念系统，它们与政法伦理这类意志行为现象、诗歌文艺这类情感宣泄现象不同。哲学与科学都是理性（广义的）的产物，目的都是认识世界的本质，因此，它们是同质同源的。
知识，是人类理性地认知世界的成果。所以，古希腊时代把他们认知的智慧的结晶统称为“哲学”，于是哲学便成为知识的总称，此时没有具有个性的哲学，也没有分门别类的科学。这种知识的笼统性在当时知识尚未充分发达之际，应该讲是极其自然的。
不要以为知识仅属于纯粹为理性所把握的东西，意志行为与情感宣泄这类主体的非理性的精神现象，如将它们客观地加以辨析，并议论短长，它们也可以成为一门科学，例如，政治学、美学之类。但是，一项政治行动、一件艺术品的创作，就不是科学作业了。它们有其不同于概念思维的独特性。我们批评的艺术作品的概念化、模式化，正是因为一种僵化的固定的形式，窒息了艺术的生命。
正因为哲学与科学同质同源，它们的分化，只是为了进一步更深入地结合，而不是永远分道扬镳，各不相涉。但是长期以来，哲学与科学各自独立发展，自成格局，不但觉得彼此之间隔行如隔山，甚至互相攻讦，试欲一比高低。我们认为这是很不正常的。由于各奔前程，哲学弄得幽冥莫测，科学搞得趣味全无。于是，哲学变成思辨的臆测，科学变成片面的偏执，从而脱离了向真理目标前进的轨道。
导论 哲学与科学分合的历史观
第一篇 认识能力的辩证发展
导语论“智力、能力、神力”的辩证圆圈运动
第一章 宇宙自然认识的神话构想与理智分析
第一节 初民解释宇宙自然的尝试
第二节 自然哲学家的科学发现与哲学构思
第三节 观察与论证方法的萌芽与知识客观性的确立
第二章 数量与质量概念的形成与辩证思维的萌芽
第一节 宗教迷惘中的理智光芒
一、毕达哥拉斯学派的宗教意识
二、毕达哥拉斯学派的科学研究
三、哲学本体论：作为世界万物本原的“数”
四、对立与和谐的辩证关系
第二节 逻辑推导与知性抽象
一、巴门尼德对“存在”范围特征的逻辑论证
二、芝诺反对“多”与“运动”的论证
三、麦里梭对巴门尼德“存在”学说的修正和补充
第三节 原子论与恒变观
一、从存在论到留基伯的原子论
二、德谟克利特的原子论与认识论
三、赫拉克利特的“永恒的活火”与“逻各斯”
第三章 知识体系的形成与知识的分化
第一节 人文知识的突出说明知识的深化
一、认识你自己
二、美德即知识
三、诘难法
第二节 数学几何式的宇宙论与辩证法的系统化
一、数学几何式的宇宙论
二、辩证法的系统化
第三节 亚里士多德：知识的分类与哲学的个性
一、哲学的个性化——实体论
二、认识论
三、政治学的独立
四、伦理学经验的科学化
五、文艺理论系统化
六、自然科学
七、逻辑学的创建
……
第二篇 实证科学的兴起
第三篇 科学的哲学归宿与哲学的科学前提
结束语
第一版后记
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