《常用生物统计学与生物信息学软件实用教程》以生命科学研究的一般规律为主线,以生物统计学与生物信息学软件为主,深入浅出地介绍生命科学研究中常用的软件,以便学生在本科阶段初步掌握生物统计学与生物信息学相关的软件操作。其包括统计类软件如正交设计助手、Excel、Origin、SPSS、Minitab 和DPS,生物信息学软件和工具如NCBI、DNA 序列比对和系统发育树的构建、引物设计、DNAMAN 软件,以及科技写作相关的软件和工具等。
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目录
前言
第一篇生物统计类软件 1
第一章正交设计助手 2
第二章 响应面设计软件Design Expert 6
1.安装 6
2.PB设计 7
3.BBD 12
第三章电子表格软件Excel 20
1.图表的制作 20
2.分析工具库的加载 23
3.数据资料的整理与描述 24
4.两平均数的差异显著性检验 28
5.方差分析 32
6.回归与相关分析 35
第四章科学作图软件Origin 40
1.安装 40
2.对几组数据进行自动运算 40
3.作柱状、条状或折线图,加误差线 42
4.多坐标轴图 45
5.多屏图 46
6.红外光谱作图 49
7.直线回归 50
第五章统计学软件SPSS 53
1.t检验 53
2.方差分析 60
3.作图 69
4.直线回归 74
5.正交表的生成 76
第六章统计学软件Minitab 82
1.数据操作 82
2.常用图形的操作 86
3.t检验 89
4.响应面设计 90
第七章数据处理系统DPS 96
1.两个样本平均数的差异显著性检验 96
2.方差分析 99
3.卡方检验 109
4.回归分析与相关分析 111
第二篇常用生物信息学软件和工具 116
第八章NCBI数据库的利用 117
1.进入NCBI主页 117
2.使用Entrez搜索 117
3.利用BankIt向GenBank数据库在线提交序列 122
第九章DNA序列比对和系统发育树的构建 126
第十章实时定量PCR目的基因保守区的查找 136
1.背景知识 136
2.操作举例 137
3.思考 142
第十一章引物设计软件Primer Premier 144
第十二章多用生物信息学软件DNAMAN 150
1.向DNAMAN中导入序列 150
2.序列比对分析 152
3.序列同源性分析 155
4.PCR引物设计 159
5.限制性酶切位点分析 161
6.绘制质粒模式图 164
7.蛋白质分析 166
第三篇其他科研软件和工具 168
第十三章文献检索 169
1.中英文文献检索 169
2.专利文献检索 172
3.免费网络资源 176
第十四章科技写作相关软件 178
1.Word中与科技写作相关的操作 178
2.文献管理软件EndNote 186
3.文本整理器 192
参考文献 196
附录 197
附录1实用软件下载方法 198
1.图书馆主页 198
2.利用网络引擎 199
3.360软件管家 200
4.专业下载网站 200
5.文档共享网站 201
6.论坛相关版块 201
附录2实用小软件 203
1.PDF 合并 203
2.PDFMate PDF Converter 204
3.备忘软件和工具 205
4.分子质量计算器 206
5.抽签软件 207
6.专业词典 207
附录3生物统计学及生物信息学软件参考大纲 208
附录4期末考核参考题目 209
附录5本科毕业论文问题 216
1.论文提纲 216
2.参考文献 216
3.英文字母和数字格式 217
4.标题编号 217
5.结果部分 218
6.讨论部分 218